## Crea en tu carpeta de alumno@carleos2.epv.uniovi.es:~/public_html ## un fichero llamado contig.pdf que contenga un histograma de los ## números que siguen a las letras tig en los nombres de las variables ## del fichero ## carleos2.epv.uniovi.es:/home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv ssh alumno@carleos2.epv.uniovi.es # me conecto con éxito cd public_html/martin/ # cambio a la carpeta destino ls -sh /home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv # veo que tiene 40M wc -l /home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv # 341 renglones ## por tanto, los renglones deben de ser largos head -n1 /home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv | wc -c # 502.435 letras ## exploro las primeras columnas de las primeras filas head /home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv | cut -c -100 ## compruebo que los campos estAn separados por comas ## y que las variables tienen nombres que comienzan por tig ## entro en R R ## dentro de R: a = read.csv("/home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv") nombres = names(a) head(nombres) # X tig... tail(nombres) # tig... tig... all (substring(nombres[-1],1,3) == "tig") # TRUE ## todas comienzan por tig menos la primera nombres = names(a)[-1] ## eliminar "tig" para conseguir los números, versión 1: numeros = as.numeric (substring (nombres, 4)) ## versión 2: numeros = as.numeric (gsub ("tig", "", nombres)) pdf("contig.pdf") hist(numeros) dev.off() ## otra opción sería haber traído el fichero al ordenador local mediante ## scp alumno@carleos2.epv.uniovi.es:/home/manadine/dat/jacatón/ContigsTPM.csv . ## y hacer el histograma localmente y enviarlo después mediante ## scp contig.pdf alumno@carleos2.epv.uniovi.es:~/public_html/martin